A gazdálkodók a támogatás meghitelezésére finanszírozási kapcsolatot kezdeményezhetnek egy általuk kiválasztott hitelintézettel. A szerződés megkötéséhez igazolni kell, hogy a gazdálkodó támogatási kérelmet nyújtott be az MVH-hoz. Ezután a bankok - saját gyakorlatuknak megfelelően - különböző mértékig hitelezik meg az összeget a kérelmezőknek.
Az MVH-nál felhívják a figyelmet arra, hogy egy gazdálkodóhoz csak egyetlen egy bankszámlaszám tartozhat, amely az MVH ügyfél-nyilvántartásában is szerepel. Kifizetés pedig kizárólag erre a nyilvántartott bankszámlaszámra történhet. A bank számára az nyújt garanciát, hogy a gazdálkodó csak a hitelintézet hozzájárulásával változtathatja meg az MVH-hoz bejelentett számlaszámot, így ugyanis biztosított a gazdának nyújtott hitel visszatérülése.
Az ügyfél-nyilvántartási rendszerbe bejelentett fizetési számlaszám módosítását az MVH abban az esetben fogadja el, ha a hitelintézet, illetve egyéb pénzügyi intézmény - például faktorcég - hozzájárult a módosításhoz és a bankszámla megváltoztatására vonatkozó megállapodást az MVH-nak bejelentette a gazdálkodó és az adott pénzügyi intézmény.